Mgr. Petr Aubrecht, Ph.D.
Odborné zaměření: Mikro/nanostrukturace povrchů, litografické technologie, replikační metody soft litografie, mikrofluidní systémy pro biologické aplikace.
Místnost: CPTO 4.07
Telefon: +420 475 286 794
E-Mail: petr.aubrecht@ujep.cz
Konzultační hodiny: dle předchozí domluvy
Research ID: IXN-7850-2023 https://www.researchgate.net/profile/Petr-Aubrecht
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-0837-1669
Vzdělání a odborný růst
2017 výzkumný pracovník, CENAB, UJEP
2017‒2024 Ph.D. ‒ Aplikovaná nanotechnologie, Přírodovědecká fakulta, UJEP Dizertační práce: Development of nano- and microstructured functional materials and microfluidic devices for bio- and medical applications
2014‒2017 Mgr. ‒ Aplikovaná nanotechnologie, Přírodovědecká fakulta, UJEP Magisterská práce: Microfiltration membrane for separation of cells
2011‒2014 Bc. ‒ Aplikovaná nanotechnologie, Přírodovědecká fakulta, UJEP Bakalářská práce: Nanostructures for biosensors and lab-on-a-chip devices
Výzkumné aktivity:
Hlavním zaměřením je vývoj nano/mikrostrukturovaných funkčních materiálů a detekčních mikrozařízení pro lékařskou diagnostiku a biologické aplikace. To zahrnuje návrh, přípravu a kompletaci mikrofluidních zařízení a jejich testování pro využití v aplikacích jako je studium toxicity na modelových organismech, separace a detekce buněčných exosomů či využití pokročilých modelů jako jsou tzv. orgány na čipu.
Výuka:
Vedení vybraných úloh v rámci předmětů Aplikované nanotechnologie: Laboratorní praktikum I (KFY/LB1), Laboratorní praktikum II (KFY/LB2), Laboratorní prakti-kum III (KFY/LB2), Laboratorní praktika z metod přípravy nanomateriálů (CNB/M102), Bio-mikroelektromechanické systémy (CNB/NA20).
Laboratorní praxe:
Fabrikační technologie: laserová, UV a elektronová litografie (EBL), reaktivní iontové leptání (RIE) a boshův proces, mikroabrazivní obrábění, nanášení tenkých vrstev napařo-váním a magnetronovým naprašováním, 2D mikro array technologie a funkcionalizace po-vrchů, 3D tiskové technologie – Fused Filament Fabrication (FFF) a stereolitografie (SLA). Charakterizační metody: optická a fluorescenční mikroskopie, konfokální mikroskopie, rastrovací elektronová mikroskopie (SEM) v kombinaci s FIB-SEM, Energiově-disperzní spektroskopie (EDX) a kontaktní profilometrie.
Absolvované kurzy:
2019 – Microscopy methods in Biomedicine, Institute of Molecular Genetics CAS, Prague, Czech Republic
2013 – Inženýrství kostní tkáně, Centrum biomedicínského výzkumu, Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i
Projektové aktivity:
Probíhající:
2024–2028 OP JAK MATBIOMED – Materiály a technologie pro bioaplikace a medicínu
2023–2028 RETEMED – Rekombinantní technologie pro medicínu
2023–2025 SGS – UJEP-SGS-2022-53-005-3: Exosomy jako nanoterapeutika pro transport přes hemoencefalitickou bariéru
Ukončené:
2022-2024 GAČR: Tvorba pokročilých nano/mikrostruktur s využitím iontových a elektro-nových svazků pro potenciální aplikace v mikrofluidních a lab-on-chip aplikacích
2018-2022 OP VVV UniQSurf: Centrum biopovrchů a hybridních funkčních materiálů.
2018-2020 SGS – UJEP-SGS-2017-53-004-3: Vývoj nano/mikrostrukturovaných funkčních materiálů a detekčních mikrozařízení pro lékařskou diagnostiku.
2018-2019 TAČR č. TJ 01000077: Zebrachip: mikrofluidní čip pro automatizované masivní in vivo testování biologických účinků aktivních látek.
2016–2019 MZ č. 16 – 29738A: Detekce cirkulujících nádorových buněk (CTC) u pacientů s adenokarcinomem plic pomocí mikrofluidního čipu.
Významné publikace z poslední doby:
MIKŠOVÁ, Romana; NEKVINDOVÁ, Pavla; AUBRECHT, Petr a MACKOVÁ, Anna. Optical response of channel waveguides in silicate glass created via ion implantation with optical barriers of varying thickness, Optics & Laser Technology, Volume 183, 2025, 112333, ISSN 0030-3992, https://doi.org/10.1016/j.optlastec.2024.112333
PANUŠKA, Petr; SMEJKAL, Jiří; ŠTOFIK, Marcel; ŽMUDOVÁ, Zuzana; ŠPANBAUEROVÁ, Klára; HAVLICA, Jaromír; HARRANDT, Václav; VINOPAL, Stanislav; AUBRECHT, Petr and Jan MALÝ. Advanced Microfluidic Platform for Tumor Spheroid Formation and Cultivation Fabricated from OSTE+ Polymer. BioChip J 18, 393–409 (2024). https://doi.org/10.1007/s13206-024-00167-x
AUBRECHT, Petr; SMEJKAL, Jiří; PANUŠKA, Petr; ŠPANBAUEROVÁ, Klára; NEUBERTOVÁ, Viktorie; KAULE, Pavel; MATOUŠEK, Jindřich; VINOPAL, Stanislav; LIEGERTOVÁ, Michaela; ŠTOFIK, Marcel a Jan MALÝ. Performance and biocompatibility of OSTEMER 322 in cell-based microfluidic applications. Online. RSC Advances. 2024, 14(6):3617-3635. ISSN 2046-2069. https://doi.org/10.1039/D3RA05789E
AUBRECHT, Petr; MALINSKÝ, Petr; NOVÁK, Josef; SMEJKAL, Jiří; JAGEROVÁ, Adéla, MATOUŠEK, Jindřich; ŠTOFIK, Marcel; LIEGERTOVÁ, Michaela; LUXA, Jan; MACKOVÁ, Anna a Jan MALÝ. Patterning of COC Polymers by Middle‐Energy Ion Beams for Selective Cell Adhesion in Microfluidic Devices. Online. Advanced Materials Interfaces. 2024, 11(18):2301077. ISSN 2196-7350. https://doi.org/10.1002/admi.202301077
CUTRONEO, Mariapompea; SILIPIGNI, Letteria; MACKOVA, Anna; MALINSKY, Petr; MIKSOVA, Romana; HOLY, Vaclav; STOFIK, Marcel; MALY, Jan; AUBRECHT, Petr; FAJSTAVR, Dominik; SLEPICKA, Petr a Lorenzo TORRISI. Mask-Assisted Deposition of Ti on Cyclic Olefin Copolymer Foil by Pulsed Laser Deposition. Online. Micromachines. 2023, 14(7):1298. ISSN 2072-666X. https://doi.org/10.3390/mi14071298
CUTRONEO, Mariapompea; TORRISI, Lorenzo; SILIPIGNI, Letteria; HAVRANEK, Vladimir; MACKOVA, Anna; MALINSKY, Petr; MIKSOVA, Romana; MALY, Jan; STOFIK, Marcel; AUBRECHT, Petr; FAJSTAVR, Dominik a Petr SLEPICKA. Laminated Cyclic Olefin Copolymer Foil by Pulsed Laser Deposition. Online. Coatings. 2023, 13(3). ISSN 2079-6412. https://doi.org/10.3390/coatings13030596
SMEJKAL, Jiří; AUBRECHT, Petr; SEMERÁDTOVÁ, Alena; ŠTOFIK, Marcel; LIEGERTOVÁ, Michaela a Jan MALÝ. Immunocapturing rare cells from blood: A simple and robust microsystem approach. Online. Biosensors and Bioelectronics. 2023, 227. ISSN 0956-5663. https://doi.org/10.1016/j.bios.2023.115155
SMEJKAL, Jiří; MALÝ, Petr; KUCHAŘ, Milan; PANOVA, Natalya; SEMERÁDTOVÁ, Alena; AUBRECHT, Petr; ŠTOFIK, Marcel a Jan MALÝ. Cell immunocapture microfluidic chip based on high-affinity recombinant protein binders. Biosensors and Bioelectronics. Online. 2021, 172. ISSN 0956-5663. https://doi.org/10.1016/j.bios.2020.112784
PANUŠKA, Petr; NEJEDLÁ, Zuzana; SMEJKAL, Jiří; AUBRECHT, Petr; LIEGERTOVÁ, Michaela; ŠTOFIK, Marcel; HAVLICA, Jaromír a Jan MALÝ. A millifluidic chip for cultivation of fish embryos and toxicity testing fabricated by 3D printing technology. Online. RSC Advances. 2021, 11(33):20507-20518. ISSN 2046-2069. https://doi.org/10.1039/D1RA00846C